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| シオクグ |  |
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| シオデ |    |
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| シカクイ |  |
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| ジガバチソウ |  |
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| シキンカラマツ |   |
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| シシウド |  |
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| シズイ |  |
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| シソクサ |   |
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| シデアブラガヤ |  |
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| シナガワハギ |  |
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| シナダレスズメガヤ |  |
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| シバ |  |
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| シマスズメノヒエ |  |
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| 仮称・シマニシキソウモドキ → ニセシマニシキソウ |
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| シャガ |  |
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| シャク |     |
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| シャクチリソバ |  |
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| シャグマハギ |   |
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| ジャコウソウ |  |
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| ジャノヒゲ |   |
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| シュウカイドウ |  |
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| ジュウニヒトエ |     |
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| シュウブンソウ |   |
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| シュウメイギク |  |
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| ジュズスゲ |  |
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| ジュズダマ |   |
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| シュロガヤツリ |  |
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| ジュンサイ |   |
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| シュンラン |  |
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| ジョウシュウカモメヅル |  |
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| ショウジョウソウ |  |
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| ショウジョウバカマ |   |
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| ショウブ |   |
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| ジョウロウスゲ |  |
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| ショカツサイ |   |
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